Análisis de las variantes de los genes ELMO1, TJP1 y ATM en la expresión clínica y como marcadores genéticos pronósticos en población mexicana con Ataxia Espinocerebelosa tipo 2.

Abstract

RESUMEN El término Ataxia Espinocerebelosa hace referencia a una degeneración del cerebelo; el centro de la coordinación, que causa falta de coordinación y movimiento, es considerada una enfermedad huérfana. Entre las variantes de ataxia, se encuentra la enfermedad neurodegenerativa Ataxia Espinocerebelosa o SCA (por sus siglas en inglés Spinocerebellar Ataxia) con un tipo de herencia autosómica dominante. Actualmente se han descrito más de 40 subtipos de SCAs. El que presenta más elevada frecuencia a nivel mundial es la SCA3, seguida de las SCA2 y SCA6; aunque en México la que presenta mayor prevalencia es la SCA2. La etiología está determinada por expansión de tripletes repetidos en genes particulares para cada ataxia, debida a una alteración en la replicación y recombinación del DNA. El número de repetidos es en general, característico de cada enfermedad. En distintas patologías neurodegenerativas, se ha descrito la participación de genes modificadores del curso o pronóstico de la enfermedad. En el caso de las SCAs, es posible que algunas variantes, cuyas proteínas codificadas participan en diferentes procesos neuronales, modifiquen el curso de la SCA2. Objetivo. Analizar las SNV ́s de los genes ELMO1, TJP1 y ATM como posibles genes modificadores en la expresión clínica y como marcadores pronósticos mediante la correlación con las características clínicas y el número de repetidos CAG en el gen ATXN2 de pacientes con Ataxia Espinocerebelosa tipo 2 del noroccidente de México. Material y Métodos. A los pacientes clínicamente afectados con ataxia espinocerebelosa se les realizó historia clínica completa, exploración física y estudio imagenológico para confirmar atrofia olivopontocerebelosa. Para la determinación del número de repetidos CAG(n) del gen ATXN2 en pacientes con ataxia espinocerebelosa autosómica dominante primero se llevó a cabo la extracción del ADN genómico de sangre periférica y posteriormente se amplificó mediante PCR punto final donde el producto se corrió en una electroforesis en gel de poliacrilamida y posteriormente se reveló con tinción de nitrato de plata,

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posteriormente se corroboró mediante la técnica IEF (isoelectroenfoque). La determinación de la longitud de los fragmentos se llevó a cabo por correlación directa con marcadores de peso molecular. Posteriormente se realizó el análisis molecular de las variantes; rs1345365 de ELMO1 (PCR-PASA), rs2291166 de TJP1 (PCR-PASA) y rs11212617 de ATM (PCR-RFLP). Resultados. En la presente tesis se incluyeron 29 pacientes de los cuales 18 fueron masculinos y 11 femeninos con SCA2 al analizar el VNTR del gen ATXN2, el rango de edad de inicio fue de 12-69 años, hubo dos decesos en pacientes de 54 y 58 años. Clínicamente más del 50% de los pacientes presentaron marcha atáxica, disdiadococinesia, dismetría, disartria y atrofia cerebelosa. En individuos con SCA2 los alelos con 37, 39, 41 y 69 repetidos CAG del gen ATXN2 fueron los más constantes, así como los genotipos 21/41(10.7%), 22/37 (14.28%) y 22/69 (10.7%). En población general los alelos con 22 y 23 repetidos CAG, y los genotipos 22/22 y 22/23 del VNTR del gen ATXN2 fueron los más frecuentes. En la distribución de genotipos en el SNV del gen TJP1 el alelo T y el homocigoto TT, fueron los más frecuentes tanto en población general como en SCA2, así como el alelo T y el homocigoto TT del SNV en ATM. Por otro lado, en el SNV del gen ELMO1 el alelo A y el heterocigoto AG fueron los más frecuentes en población general, mientras que en SCA2 el de mayor frecuencia fue el homocigoto AA,

encontrándose en equilibrio Hardy-Weinberg (EHW). La correlación genotipo- fenotipo los genotipos AG y GG mediante los modelos de herencia codominante y

dominante respectivamente se asociaron a riesgo moderado con SCA2, por otro lado las SNV de los genes TJP1 y ATM no se observó correlación. Conclusión. Se analizaron 29 individuos con SCA2 del Occidente de México en quienes se correlacionaron las características clínicas con los SNVs de los genes ELMO1, TJP1 y ATM sin obtener un valor p significativo mediante análisis estadístico, aunque se encontró un incremento del riesgo asociación de riesgo moderado para desarrollar SCA2 en los portadores del genotipo AA (p= 0.0252; OR= 2.524; IC= 1.102 – 5.781)

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del SNV rs1345365 del gen ELMO, considerando que la razón de momios es mayor a 1.