Análisis de las características bioquímicas y genéticas de pacientes con hipercolesterolemia familiar, residentes en el municipio de Santa María Yucuhiti, Oaxaca

Abstract

RESUMEN ANTECEDENTES. La hipercolesterolemia familiar (HF) es una enfermedad autosómica dominante definida por una elevación de colesterol LDL (c-LDL), lo cual provoca ateroesclerosis e incrementa el riesgo de desarrollar Enfermedad Cardiovascular (ECV) prematura. La HF es causada principalmente por variantes en los genes LDLR y APOB. En general, la prevalencia a nivel mundial de HF heterocigota (heHF) es de1:200-500. En el estudio realizado por Hernández-Flores y cols, se captaron 13 pacientes mexicanos homocigotos con HF, siendo que más de la mitad de estos eran originarios del estado de Oaxaca, por ello se asume que la frecuencia de los heHF en algunas comunidades será elevada, lo cual hace pertinente su estudio. OBJETIVO. Análisis de las características bioquímicas y moleculares de pacientes con hipercolesterolemia familiar, residentes en el municipio de Santa María Yucuhiti, Oaxaca. MATERIAL Y MÉTODOS. En el municipio de Santa María Yucuhiti, ubicado en la Sierra Mixteca del estado de Oaxaca, se realizó un tamizaje poblacional para la identificación de pacientes con HF. Todos los individuos que accedieron a participar firmaron una carta de consentimiento informado, así mismo, el llenado de una historia clínica y la extracción de 10 ml de sangre periférica para la cuantificación de lípidos y obtención de ADN (método CTAB/DTAB). Los individuos adultos con c-LDL ≥170 mg/dL y los niños con >130 mg/dL con y sin antecedentes personales-familiares de hipercolesterolemia, se clasificaron con diagnóstico sugestivo de HF y se incluyeron en el estudio molecular. el cual consistió en el análisis del gen LDLR por medio de secuenciación y MLPA. Adicionalmente, se buscaron variantes puntuales y pequeñas deleciones en un fragmento (547pb) del exón 26 del gen APOB (secuenciación), en el cual se han descrito el mayor número de alteraciones relacionadas con HF. Análisis estadístico: Las variables cuantitativas fueron comparadas usando estudios paramétricos (T de student y ANOVA) o no paramétricos (U-Mann Whitney o Kruskal Wallis). Las frecuencias alélicas y genotípicas de las variantes se obtuvieron por conteo directo y se compararon por medio de chi-cuadrada con la información reportada en dos bases de datos: 1) la población residente de los Ángeles con ancestría mexicana (estudio de los 1000 genomas) y 2) la población de Latinos del estudio de gnomAD exomes r2.1.1 RESULTADOS. En total se estudiaron 1810 individuos provenientes de nueve comunidades que conforman el municipio de Santa María Yucuhiti, de los cuales 192 (10.6%) tuvieron diagnóstico de sugestiva HF, siendo el 27.6% (n=53 menores de edad y el 72.4% (n=139) adultos. La media de c-LDL fue 225.2±55.1 mg/dL (rango 131.4-383.2 mg/dL). El estudio molecular inició con el tamizaje del exón 15 del gen LDLR donde se localiza la variante c.2271del, la cual había sido previamente detectada en un paciente HoHF proveniente de una comunidad del municipio de Santa María Yucuhiti. En el 76 % (n=146/192) de los pacientes se detectó la variante c.2271del en estado heterocigoto, posteriormente, se llevó a cabo el análisis de familiares consanguíneos; se incluyeron 174 individuos y 15 tuvieron la variante (8.6%), ellos presentaron un rango de c-LDL de 60 a 168 mg/dL con una media de 133±34.7 mg/dL. De los 46 pacientes sin la deleción, 30 son no consanguíneos y en ellos se analizaron los 17 exones restantes del gen LDLR y el fragmento del gen APOB; sin embargo, no se encontraron variantes patogénicas que expliquen el fenotipo de la enfermedad. En el gen LDLR se identificaron 16 variantes “comunes”, donde las dos más frecuentes fueron p.R744= (98.3%) y p.R471= (78.3%). La comparación de las frecuencias alélicas y genotípicas con alguna de las dos poblaciones de referencia permitió observar que seis variantes presentaron diferencias significativas: dos bajo el modelo recesivo (c.1060+10G>C (OR=3) y c.2548-48A>G (OR=4.1), una bajo modelos recesivo c.1359-30C>T (OR= 3) y dominante (OR= 5.5) y tres bajo modelo codominante (p.D47= (OR=8973.2), c.313+47G>A (OR=4322.4) y c.*18C>T (OR=48.7). La variante p.R3638Q en el gen APOB se observó en seis pacientes (5 heterocigotos y 1 homocigoto) y tanto la literatura como los análisis in silico (Polyphen2, Mutation Taster y SIFT) determinaron que es una variante benigna. Con estos resultados, la frecuencia de HF en el municipio de Santa María Yucuhiti es del 11.4% (n=207/1810), 161 pacientes con diagnóstico clínico-bioquímico-genético y 46 con diagnóstico clínico-bioquímico. CONCLUSIÓN. La hipercolesterolemia familiar es un grave problema de salud en el municipio de Santa María Yucuhiti con una frecuencia del 11.4%. Este número elevado de pacientes afectados es consecuencia de un efecto fundador y un alto grado de endogamia entre las comunidades, esto se asume dado que el 77.8% de los pacientes presentaron la misma variante patogénica c.2271del. En este estudio se observó una gran heterogeneidad bioquímica, los rangos de c-LDL en 161 pacientes heterocigotos para la variante c.2271del fueron muy amplios: 60 mg/dL a 383.2 mg/dL, por ende, diversas variantes en distintos genes deben estar implicadas en la modulación de los niveles de lípidos. El 22.2% de los pacientes con fenotipo bioquímico de HF no presentó variantes en los genes LDLR y APOB, por lo que será necesario el análisis del gen PCSK9. Aun cuando el rasgo de herencia familiar de la hipercolesterolemia se observa en algunos casos, no podemos descartar que el diagnóstico de estos pacientes sea hipercolesterolemia de tipo poligénica.