DETERMINACIÓN DE GENES EXPRESADOS DIFERENCIALMENTE Y SU INTERACCIÓN EN PULPITIS IRREVERSIBLE MEDIANTE UN ANÁLISIS

Abstract

INTRODUCCIÓN: La pulpitis irreversible es un proceso inflamatorio, que se da por un infiltrado de microorganismos en la pulpa. El diagnóstico de esta patología está basado en signos clínicos objetivos y subjetivos. La ruta principal de entrada de los microorganismos es debido a caries dental, un traumatismo, túbulos dentinarios expuestos, grietas dentinales o por medio de los forámenes apicales. La pulpitis irreversible suele ser asintomática, aunque en algunos casos se presenta de manera sintomática. OBJETIVO: El objetivo de este estudio es determinar posibles genes expresados diferencialmente y su interacción en pulpitis irreversible mediante un análisis de bases de datos preexistentes. MÉTODO: La búsqueda general se hizo en la página oficial del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). La información particular de expresión génica se revisó en la base de datos de Expresión de Genes Omnibus (GEO). Posteriormente se realizó la predicción de las interacciones entre proteínas utilizando la herramienta de búsqueda para la recuperación de genes que interactúan (STRING, versión 11.5). Finalmente integramos las interacciones en las siguientes categorías según la información contenida en las bases de datos GENE ONTOLOGY (GO) y KEGG PATHWAYS. RESULTADOS: Para este estudio se identificaron 53618 genes expresados diferencialmente, considerando la relación logarítmica de los valores de expresión de un gen o transcripción en las dos condiciones diferentes como criterio, en donde destacan: IGKV-5, IGHV3-72, IGHD, GRCh37 y CXCL8. Los genes subexpresados en ellos encontramos FRRS1L, ATP1B2, CCDC162P, STAG2-AS1 Y SMAD5. Posteriormente, se generó la red de interacciones con los genes sobreexpresados, en dónde encontramos un total de 39 nodos, el coeficiente de agrupación local igual a 0.61 y un valor de P de enriquecimiento