SIMULACIÓN DINÁMICA MOLECULAR EN SOLUCIÓN SALINA CON LA TOXINA CROTAMINA.

Abstract

Resumen. 6 Se realizaron simulaciones de dinámica molecular para investigar los efectos estructurales de las soluciones salinas en toxinas del veneno de Crotalus durissus terrificus, presentando como caso de estudio la toxina de la crotamina. Tres soluciones salinas divalentes (CaCl 2, MgCl 2 y ZnCl 2), así como dos soluciones salinas monovalentes (KCl y NaCl) se analizaron mediante la evaluación de funciones de distribución radial (RDF) para identificar las interacciones clave entre iones monovalentes y divalentes en la toxina crotamina. Además, ocho pares más representativos se analizaron, a saber, Cation – Cation (CC), Anion – Anion (AA), Cation – Anion (CA), Cation – Protein (CP), Proteína-anión (PA), agua-catión (WC), agua-anión (WA) y agua-proteína (WP) en una solución acuosa ambiente de la toxina crotamina. El efecto de la fuerza iónica de la toxina se evaluó agregando sal soluciones en una solución acuosa. Las concentraciones de sal agregadas fueron 0.5, 1.0 y 1.5 M a 300 K. descubrió que la toxina crotamina no es solo un inhibidor potente y específico de ciertos canales de Na +, como documentado experimentalmente, pero también tiene una gran afinidad con otros tipos de canales como Ca 2+. Las simulaciones mostraron que esta toxina puede transportar iones Ca 2+ a través de la formación de una bolsa en su interior formado por una disposición estructural específica de uno de sus bucles principales, es decir, los residuos del segundo bucle (Gly26 – Trp34). Nuestros resultados contribuyen en gran medida a la comprensión de los sitios de detección y reconocimiento. entre las soluciones salinas de unión y la toxina venenosa Crotamina, así como el transporte de iones a través de su estructura.