1. RIUdeG
  2. Tesis
  3. Doctorado
  4. CUCS
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dc.contributor.authorFernández Ávila, Leonardo
dc.date.accessioned2024-09-18T17:31:44Z-
dc.date.available2024-09-18T17:31:44Z-
dc.date.issued2024-02-07
dc.identifier.urihttps://wdg.biblio.udg.mx
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12104/104876-
dc.description.abstractIntroducción: En México el Cáncer Cervicouterino (CaCU) está posicionado en el tercer y segundo lugar en incidencia y mortalidad, en patologías asociadas a cáncer en mujeres, siendo las infecciones persistentes por Virus del Papiloma Humano (VPH) el principal factor de riesgo. Los oncogenes E6 y E7 de los VPH poseen un efecto inmunomodulador que está relacionado con la inducción de procesos carcinogénicos, mediante la expresión descontrolada de distintas moléculas. Ya que las quimiocinas fungen un papel crucial en la respuesta inmune innata y adaptativa para la eliminación del VPH, fue de nuestro interés analizar su expresión asociada a la presencia de E6 y E7, así como su valor pronóstico en desarrollo del CaCU. Objetivo General: Evaluar la expresión de quimiocinas modulada por los oncogenes E6 y E7 de diversos VPH frecuentes en CaCU en población mexicana. Metodología: Se analizó la expresión de un panel de quimiocinas tanto en líneas celulares derivadas de CaCU (SiHa, CasKi, HeLa, SW756 y C33A), como en modelos celulares que expresan constitutivamente los oncogenes E6 y E7 de los VPH -16, -18, -38b, -107, y -122, mediante secuenciación de nueva generación (NGS) y validadas por RT-qPCR. Adicionalmente, se determinó la expresión de las mismas utilizando la herramienta OncoDB y una base de datos de 324 biopsias de carcinoma cervical de células escamosas (CESC). Finalmente, se realizaron análisis de sobrevida (Kaplan-Meier) utilizando bases de datos del repositorio “The Cancer Genome Atlas Program” (TCGA). Resultados: CXCL2 y CXCL8 son modulados por la expresión de E6 y E7 de diversos genotipos de VPH y se sobreexpresan en líneas celulares derivadas de CaCU y en biopsias con CESC. Este comportamiento impacta desfavorablemente la sobrevida en pacientes con CaCU. Conclusiones: La evaluación de los niveles de expresión de CXCL2 y CXCL8 podría constituir una contribución valiosa a las técnicas de cribado utilizadas en el pronóstico de lesiones cervicales.
dc.description.tableofcontentsÍndice de Figuras y Tablas.......................................................................................................... 7 Abreviaturas................................................................................................................................ 9 Resumen....................................................................................................................................... 12 Abstract........................................................................................................................................ 13 Introducción................................................................................................................................. 14 I. Antecedentes........................................................................................................................... 16 Los Orígenes del Cáncer........................................................................................................... 16 Marcas Distintivas del Cáncer................................................................................................. 18 Epidemiología del Cáncer........................................................................................................ 24 Cáncer Cervicouterino.............................................................................................................. 25 Papilomavirus............................................................................................................................ 27 Biología Molecular del VPH..................................................................................................... 29 Oncoproteínas Relacionadas a Procesos Carcinogénicos................................................... 30 Mecanismo de Infección.......................................................................................................... 31 Respuesta del Sistema Inmune contra VPH.......................................................................... 33 Modelos in vitro para el Estudio de la Transformación Maligna Dependiente de VPH.. 35 Quimiocinas............................................................................................................................... 37 Antecedentes del Grupo de Trabajo...................................................................................... 41 II. Pregunta de Investigación..................................................................................................... 45 III. Planteamiento del Problema............................................................................................... 45 IV. Justificación............................................................................................................................ 46 V. Hipótesis.................................................................................................................................. 46 VI. Objetivos................................................................................................................................. 47 VII. Diseño Metodológico.......................................................................................................... 48 Tipo de Estudio.......................................................................................................................... 48 Universo de Trabajo................................................................................................................. 48 Sede del Estudio........................................................................................................................ 48 Diagrama Metodológico.......................................................................................................... 48 Técnicas...................................................................................................................................... 49 Cultivo celular...................................................................................................................... 49 Extracción de RNA............................................................................................................... 49 Síntesis cDNA....................................................................................................................... 51 Reacción en Cadena de la Polimerasa Cuantitativa en Tiempo Real........................... 52 RNAseq................................................................................................................................. 53 Análisis Bioinformáticos..................................................................................................... 53 Perfiles de Expresión.......................................................................................................... 54 Análisis de Supervivencia................................................................................................... 54 Análisis Estadístico.............................................................................................................. 55 VIII. Aspectos Éticos.................................................................................................................... 55 IX. Recursos, Financiamiento y Factibilidad............................................................................ 56 X. Aspectos de Bioseguridad..................................................................................................... 56 XI. Resultados.............................................................................................................................. 57 Análisis de expresión diferencial de los genes de quimiocinas a partir de RNAseq de los modelos transducidos con los oncogenes E6/E7 en fibroblastos.................................. 57 Análisis de cuantificación relativa de la expresión de CCL2, CCL5, CCL20, CXCL2, CXCL6 y CXCL10 en los modelos transducidos con los oncogenes E6/E7 en fibroblastos............ 60 Análisis de expresión diferencial de los genes de quimiocinas a partir de RNAseq de los modelos de sobreexpresión de los oncogenes E6 y E7 en queratinocitos (Línea celular HaCaT) ............................................................................................................................ 63 Análisis de cuantificación relativa de la expresión de CCL2, CCL20, CCL28, CXCL2, CXCL6, CXCL8 y CXCL10 en los modelos de sobreexpresión de los oncogenes E6 y E7 en queratinocitos........................................................................................................................ 67 Análisis de expresión diferencial de los genes de quimiocinas a partir de RNAseq en líneas celulares derivadas de CaCU.......................................................................................... 69 Análisis de cuantificación relativa de la expresión de CCL2, CCL5, CCL28, CXCL2, CXCL3, CXCL5, CXCL8, CXCL10, CXCL11 y CXCL12 en líneas celulares derivadas de CaCU 70 Análisis de sobrevida de las quimiocinas diferencialmente expresadas, basados en muestras del TCGA..................................................................................................................... 76 XII. Discusión............................................................................................................................... 79 XIII. Conclusiones........................................................................................................................ 84 XIV. Limitaciones y Perspectivas............................................................................................... 84 XV. Cronograma de Actividades................................................................................................ 85 XVI. Anexos.................................................................................................................................. 86 XVII. Fuentes y Referencias Bibliográficas............................................................................... 88 XVIII. Productos........................................................................................................................... 101 XIX. Congresos............................................................................................................................. 106
dc.formatapplication/PDF
dc.language.isospa
dc.publisherBiblioteca Digital wdg.biblio
dc.publisherUniversidad de Guadalajara
dc.rights.urihttps://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp
dc.subjectOncogenes E6
dc.subjectOncogenes E7
dc.subjectVph
dc.subjectFrecuentes En Cacu
dc.subjectPoblacion Mexicana
dc.title“Regulación de la expresión de quimiocinas mediada por los oncogenes E6 y E7 de genotipos del Virus del Papiloma Humano”
dc.typeTesis de Doctorado
dc.rights.holderUniversidad de Guadalajara
dc.rights.holderFernández Ávila, Leonardo
dc.coverageGUADALAJARA, JALISCO
dc.type.conacytdoctoralThesis
dc.degree.nameDOCTORADO EN CIENCIAS BIOMEDICAS
dc.degree.departmentCUCS
dc.degree.grantorUniversidad de Guadalajara
dc.rights.accessopenAccess
dc.degree.creatorDOCTOR EN CIENCIAS BIOMEDICAS
dc.contributor.directorAguilar Lemarroy, Adriana Del Carmen
dc.contributor.codirectorJave Suárez, Luis Felipe
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