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https://hdl.handle.net/20.500.12104/104817Registro completo de metadatos
| Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | Gómez Morales, Xochitl Iveth | |
| dc.date.accessioned | 2024-09-18T17:07:17Z | - |
| dc.date.available | 2024-09-18T17:07:17Z | - |
| dc.date.issued | 2024-07-05 | |
| dc.identifier.uri | https://wdg.biblio.udg.mx | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12104/104817 | - |
| dc.description.abstract | Explorar las notables capacidades regenerativas del ajolote, particularmente la regeneración del cerebro se revela como un pilar fundamental para la obtención de conocimientos esenciales en el ámbito de la biomedicina y la neuro-regeneración. Este estudio tiene como objetivo principal la identificación de módulos de co-expresión génica pertinentes en el telencéfalo del ajolote durante su proceso de regeneración tras una lesión, empleando hdWGCNA. Asimismo, buscamos contrastar la variabilidad en la expresión génica entre la regeneración y el desarrollo normal mediante el uso de CIBERSORTx. Nuestros hallazgos indican una interdependencia entre células, en la que los cambios en la composición génica alteran otras células. Se identificaron patrones de expresión génica distintivos en diferentes tipos celulares a lo largo del proceso de regeneración, revelando una compleja red de interacciones génicas que coordinan la reparación y la remodelación del tejido cerebral. | |
| dc.description.tableofcontents | Índice general Agradecimientos ....................................................................................................... - 1 - Resumen .................................................................................................................. - 7 - Abstract ................................................................................................................... - 8 - 1.- Introducción ........................................................................................................ - 9 - 2.- Marco teórico .................................................................................................... - 10 - 2.1 Neuro-Regeneración celular ............................................................................ - 10 - 2.2 Neuro-regeneración en Ambystoma mexicanum ................................................. - 10 - 2.3 Comunicación celular en la neuro-regeneración ................................................ - 11 - 2.4 RNA-seq ....................................................................................................... - 12 - 2.3.1 Bulk RNA-seq ......................................................................................... - 12 - 2.3.2 Single-cell RNA-seq ................................................................................ - 12 - 2.3.3 Espacio-Temporal RNA-seq ..................................................................... - 12 - 2.4 Redes de co-expresión .................................................................................... - 13 - 2.4.1 Redes de co-expresión ponderadas ............................................................ - 13 - 2.5 Herramientas computacionales ........................................................................ - 14 - 2.5.1 Lenguaje R ............................................................................................. - 14 - 2.5.2 Seurat ..................................................................................................... - 14 - 2.5.3 hdWGCNA ............................................................................................. - 14 - 2.5.4 CIBERSORTx ........................................................................................ - 16 - 3.- Objetivos .......................................................................................................... - 16 - 3.1 Objetivo general ............................................................................................ - 16 - 3.2 Objetivos específicos...................................................................................... - 16 - 4.- Planteamiento del problema ................................................................................ - 17 - 5.- Justificación ...................................................................................................... - 17 - 6.- Materiales y métodos .......................................................................................... - 18 - 6.1 Recolección de datos ...................................................................................... - 19 - 6.2 Algoritmo de reducción de dimensionalidad ..................................................... - 19 - 6.3 CIBERSORTX .............................................................................................. - 19 - 6.3.1 Acceso a archivos Stereo-seq .................................................................... - 19 - 6.3.2 Cambio de nombres de columnas: Identificador célular/génico y nombre célular/genico .................................................................................................. - 20 - 6.3.3 Recuperación de matriz de expresión BULK .............................................. - 20 - 6.3.4 Matriz de firmas y construcción de proporciones con CIBERSORTx ............ - 20 - 6.4 High dimensional WGCNA (hdWGCNA) ........................................................ - 20 - 6.4.1 Configuración de datos ............................................................................. - 20 - 6.4.2 Creación de las meta-células ..................................................................... - 20 - 6.4.3 Análisis de topología de red scale-free (libre de escala) ............................... - 21 - 6.4.5 Módulos de co-expresión .......................................................................... - 21 - 6.4.6 Conectividad de modulos ......................................................................... - 21 - 6.5 Localización espacial ..................................................................................... - 21 - 6.6 Genes únicos durante el proceso de regeneración .............................................. - 21 - 6.6.1 Células que expresan genes de la regeneración ........................................... - 22 - 7.- Resultados y Discusión ....................................................................................... - 22 - 7.1 Proporciones celulares a través del tiempo ........................................................ - 22 - 8 - Conclusión ........................................................................................................ - 49 - | |
| dc.format | application/PDF | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.publisher | Biblioteca Digital wdg.biblio | |
| dc.publisher | Universidad de Guadalajara | |
| dc.rights.uri | https://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp | |
| dc.subject | Neuroregeneracion Celular | |
| dc.subject | Perfiles De Expresion | |
| dc.subject | Ambystoma Mexicanum | |
| dc.title | Exploración de perfiles de expresión en tejidos cerebrales de Ambystoma mexicanum y su participación en la neuroregeneración celular | |
| dc.type | Tesis de Maestría | |
| dc.rights.holder | Universidad de Guadalajara | |
| dc.rights.holder | Gómez Morales, Xochitl Iveth | |
| dc.coverage | GUADALAJARA, JALISCO | |
| dc.type.conacyt | masterThesis | |
| dc.degree.name | MAESTRIA EN CIENCIAS EN BIOINGENIERIA Y COMPUTO INTELIGENTE | |
| dc.degree.department | CUCEI | |
| dc.degree.grantor | Universidad de Guadalajara | |
| dc.rights.access | openAccess | |
| dc.degree.creator | MAESTRIA EN CIENCIAS EN BIOINGENIERO EN Y COMPUTO INTELIGENTE | |
| dc.contributor.director | Romero Gutiérrez, María Teresa | |
| dc.contributor.codirector | Mendizábal Ruiz, Adriana Patricia | |
| Aparece en las colecciones: | CUCEI | |
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