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https://hdl.handle.net/20.500.12104/84722
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Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
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dc.contributor.advisor | Rosas Espinoza, Veronica Carolina | |
dc.contributor.advisor | Palomera Avalos, Veronica | |
dc.contributor.author | Urzúa Sánchez, Álvaro | |
dc.date.accessioned | 2021-10-05T19:46:32Z | - |
dc.date.available | 2021-10-05T19:46:32Z | - |
dc.date.issued | 2016-09-29 | |
dc.identifier.uri | https://wdg.biblio.udg.mx | |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12104/84722 | - |
dc.description.abstract | RESUMEN En el presente trabajo se estudiaron los niveles de variación genética y flujo génico de Ambystoma flavipiperatum, especie endémica del centro oeste del estado de Jalisco, en el Área Natural Protegida de Sierra de Quila (APFFSQ). Se analizaron con seis SSRs, 103 individuos colectados en cinco arroyos de flujo permanente. El marcador AcalD001 mostró una alta frecuencia de alelos nulos (0.204) por lo que se descartó del análisis, con los cinco marcadores restantes se detectaron un total 28 alelos. En general, la variabilidad genética en los cinco arroyos fue alta (HE=0.523-0.681). El arroyo La Ciénega mostró los mayores parámetros de variación genética y Los Molinitos fue el arroyo más diferenciado. El análisis de Mantel mostró un coeficiente de correlación positivo, pero no significativo, entre las distancias genéticas de A. flavipiperatum y las distancias geográficas de los arroyos. Con GENELAND se identificaron tres subpoblaciones, la primera formada por los individuos de los arroyos La Lira y El Pozo, la segunda por los de Agua Fría y La Ciénega y la última por los de Los Molinitos. El análisis de varianza (AMOVA) indicó que la mayor porción de la variación de A. flavipiperatum se encuentra dentro de las subpoblaciones (95%) y en menor medida entre estas (5%). El flujo genético entre las dos primeras subpoblaciones fue alto (Nm=24.75), mientras que el número de migrantes entre estas dos subpoblaciones y Los Molinitos se redujo a Nm < 3. El arroyo Los Molinitos, además de ubicarse en la microcuenca más alejada, con una mayor inclinación de pendiente, se encuentra separado por el cerro El Huehuentón, lo que indica que la topografía misma de Sierra de Quila podría jugar un papel importante en la dispersión del ajolote. En general, A. flaviviperatum de Sierra de Quila presenta altos niveles de variación genética (HE=0.590) y una diferenciación genética moderada (FST=0.078). El índice de endogamia (FIS=0.132) indica un ligero exceso de homocigotos. Los hallazgos de este trabajo pueden tener importantes implicaciones para la conservación de A. flavipieratum en el área de estudio. | |
dc.description.tableofcontents | CONTENIDO ÍNDICE GENERAL ÍNDICE DE CUADROS ....................................................................................................... iii ÍNDICE DE FIGURAS .......................................................................................................... v INTRODUCCIÓN .................................................................................................................. 1 ANTECEDENTES ................................................................................................................. 3 Género Ambystoma: taxonomía y distribución ................................................................... 3 Ambystoma: características morfológicas y paedomorfosis ............................................... 4 Ciclo reproductivo de los ambistomátidos .......................................................................... 6 Ambystoma: hábitat y movimiento ..................................................................................... 7 Estatus de conservación del género Ambystoma ................................................................. 9 Ambystoma flavipiperatum ............................................................................................... 10 Diversidad genética ........................................................................................................... 11 Marcadores moleculares ................................................................................................... 13 Microsatélites .................................................................................................................... 13 Diversidad genética en Ambystoma .................................................................................. 14 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA ............................................................................. 16 JUSTIFICACIÓN ................................................................................................................. 17 HIPÓTESIS .......................................................................................................................... 18 OBJETIVO GENERAL ....................................................................................................... 18 OBJETIVOS PARTICULARES .......................................................................................... 18 MATERIALES Y MÉTODOS ............................................................................................. 19 Área de estudio ................................................................................................................. 19 Obtención de muestras en campo ..................................................................................... 20 Extracción de ADN ........................................................................................................... 22 Amplificación de los SSRs ............................................................................................... 22 Genotipificación de las muestras ...................................................................................... 23 Análisis de datos ............................................................................................................... 26 Identificación de alelos nulos ........................................................................................ 26 Diversidad genética de A. flavipiperatum por arroyo .................................................. 26 Diferenciación genética y flujo genético ....................................................................... 26 Estructura genética ....................................................................................................... 27 Diversidad genética y flujo génico por subpoblación ................................................... 28 ii RESULTADOS .................................................................................................................... 29 Extracción de ADN genómico .......................................................................................... 29 Marcadores SSRs .............................................................................................................. 29 Alelos nulos y desequilibrio de ligamiento ....................................................................... 29 Equilibrio de Hardy-Weinberg ......................................................................................... 31 Diversidad genética por arroyo ......................................................................................... 31 Diferenciación genética y flujo génico ............................................................................. 35 Estructura genética ............................................................................................................ 37 Diversidad, diferenciación y flujo genético por subpoblación ........................................ 39 DISCUSIÓN ......................................................................................................................... 42 Marcadores SSRs .............................................................................................................. 42 Equilibrio de Hardy Weinberg y alelos nulos ................................................................... 42 Diversidad genética ........................................................................................................... 43 Diferenciación genética y flujo génico ............................................................................. 45 Estructura genética ............................................................................................................ 47 Conservación .................................................................................................................... 49 CONCLUSIONES ................................................................................................................ 51 LITERATURA CITADA ..................................................................................................... 52 ANEXO 1. Protocolos de laboratorio ................................................................................... 65 Extracción de ADN genómico .......................................................................................... 65 Protocolo de extracción .................................................................................................... 66 PCR-SSRs y Protocolo ..................................................................................................... 67 Protocolo de PCR-SSRs .................................................................................................... 67 Programa de amplificación de SSRs de Ambystoma californiense. ................................. 68 Electroforesis en geles de agarosa .................................................................................... 69 Electroforesis en geles de acrilamida ................................................................................ 70 Protocolo de tinción .......................................................................................................... 71 ANEXO 2. Patrones de amplificación de los SSRs ............................................................. 72 | |
dc.format | application/PDF | |
dc.language.iso | spa | |
dc.publisher | Biblioteca Digital wdg.biblio | |
dc.publisher | Universidad de Guadalajara | |
dc.rights.uri | https://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp | |
dc.subject | Genetica Y Flujo Genico Del Ajolote | |
dc.title | VARIACIÓN GENÉTICA Y FLUJO GÉNICO DEL AJOLOTE (Ambystoma flavipiperatum) EN SIERRA DE QUILA, JALISCO, MÉXICO | |
dc.type | Tesis de Licenciatura | |
dc.rights.holder | Universidad de Guadalajara | |
dc.rights.holder | Urzúa Sánchez, Álvaro | |
dc.coverage | ZAPOPAN JALISCO | |
dc.type.conacyt | bachelorThesis | |
dc.degree.name | LICENCIATURA EN BIOLOGIA | |
dc.degree.department | CUCBA | |
dc.degree.grantor | Universidad de Guadalajara | |
dc.degree.creator | LICENCIADO EN BIOLOGIA | |
dc.contributor.director | Castro Felix, Luz Patricia | |
Aparece en las colecciones: | CUCBA |
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