ANÁLISIS FILOGENÉTICO DE 8 GRUPOS ÉTNICOS DEL NORTE DE MÉXICO MEDIANTE Y-STRs y Y-SNPs

Abstract

Introducción. Los marcadores del cromosoma Y están representados por Y-SNPs y Y-STRs, los cuales definen haplogrupos y haplotipos, respectivamente. El análisis conjunto de haplotipos y haplogrupos permite inferir el origen, componente de mezcla poblacional (africano, amerindio, asiático, caucásico, europeo), antigüedad de los haplogrupos y la relación genética entre poblaciones. Aunque se han realizado diversos estudios para establecer relaciones filogenéticas entre los nativos americanos mediante haplogrupos y haplotipos del cromosoma Y, existen pocos estudios que describan las relaciones genéticas de los grupos étnicos mexicanos del norte. Objetivo. Definir las relaciones filogenéticas vía paterna de 8 etnias mexicanas del Norte de México mediante el análisis de 7 Y-SNPs y 17 Y-STRs. Material y métodos. Se amplificaron por PCR 17 Y-STRs con el kit comercialAmpFlSTR® Yfiler® y se realizó una PCR múltiplex que incluya los Y-SNPs de los haplogrupos nativo americanos Q (P36, M242, y M3) y C* (M217). Para determinar el mestizaje se tipificaron los Y-SNPs M207 del haplogrupo R* y YAP del haplogrupo DE* para establecer el origen europeo y africano de los cromosomas Y, respectivamente. Además, se realizó un análisis in silico para la predicción de haplogrupos a partir de los haplotipos Y-STRs obtenidos en cada muestra. Análisis estadístico. Se obtuvieron las frecuencias alélicas y la distribución de haplotipos y haplogrupos, así como parámetros de diversidad en las muestras poblacionales analizadas. Se evaluaron posibles escenarios de diferenciación o de estructura genética entre los grupos étnicos mediante diversos métodos estadísticos y softwares de libre acceso. Resultados: Se obtuvieron las frecuencias alélicas y la distribución de haplotipos entre los diferentes grupos étnicos. La mayoría de los alelos modales obtenidos corresponden con lo reportado previamente para grupos amerindios. Además, se estimaron parámetros de diversidad haplotipica para los 17 Y-STRs en los ocho grupos étnicos. Se obtuvo la distribución de haplogrupos en grupos indígenas, tanto mediante predicción en plataformas online, como por genotipificado. En resumen, se encontró que el componente ancestral de las etnias mexicanas se puede explicar según tres componentes principales: amerindio (Q1, Q-L54 y Q-M3), europeo (R, I e J) y africano (DE). Se realizó un análisis de AMOVA para evaluar la estructura poblacional de los grupos étnicos, en donde se descartó que las agrupaciones lingüísticas o geográficas expliquen la diferenciación genética entre las poblaciones nativas de México que fueron analizadas.