Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: https://hdl.handle.net/20.500.12104/106849
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dc.contributor.authorRivera Vargas, Jehú
dc.date.accessioned2024-09-27T18:44:45Z-
dc.date.available2024-09-27T18:44:45Z-
dc.date.issued28/11/2022
dc.identifier.urihttps://wdg.biblio.udg.mx
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12104/106849-
dc.description.abstractEl cáncer colorrectal es una enfermedad compleja y heterogénea, por su localización, curso clínico variable, diferencias genéticas, raciales y de estilo de vida. A nivel mundial ocupa el tercer lugar en frecuencia y cuarto lugar como causa de mortalidad. Los mecanismos moleculares involucrados en el origen del cáncer colorrectal son las alteraciones epigenéticas y la inestabilidad genómica, que a su vez se divide en inestabilidad cromosómica e inestabilidad de microsatélites. La inestabilidad cromosómica es causa de la aneuploidía observada en cáncer colorrectal esporádico y familiar. Ocurre en el 70-85% de los casos, ocasiona cambios en el número copias y estructura cromosómica, ocasionando pérdida de la heterocigosidad en genes supresores de tumor y mutaciones en protooncogenes. La amplificación de sondas dependiente de ligación múltiple (MLPA) es una técnica que nos permite el estudiio de las aberraciones cromosómicas, su aplicación en cáncer colorrectal se ha limitado al estudio de las alteraciones cromosómicas estructurales. Las sondas MLPA-subteloméricas no han sido previamente utilizadas para la detección de aberraciones cromosómicas en pacientes diagnosticados con cáncer colorrectal. El objetivo de este estudio es determinar las aberraciones cromosómicas presentes en muestras de pacientes con cáncer colorrectal esporádico mediante el uso de sondas MLPA-subteloméricas y su corroboración con sondas MLPA complementarias en el caso de alteraciones estructurales y sondas FISH de enumeración satelital y locus específicos para las alteraciones numéricas inferidas. Estudiamos 102 muestras de pacientes con CCR esporádico usando por primera vez MLPA sondas subteloméricas. Detectamos ACE tanto por perdida como por ganancia en el 89% de los casos. Las ACE más frecuentes por ganancia estructural fueron la de los cromosomas 7p22 (68.6%), 7q36 (23.5%), 20q13 (20.5%), 20p13 (19.6%), 13q12 (18.6%), 16p13 (15.6%), 1p36 (12.7%), 1q44 (9.8%), 1Dq26 (8.8%), 13q34 (7.8%), 6p25 (6.8%) y Xq28 (5.8%); por delación fueron la de los cromosomas 12q24 (17.6%), 4q35 (11.7%), 3p26 (8.8%), 4p16 (8.8%), 22q13 (8.8%), 2p25 (6.8%), 22q11 (6.8%), 8p23 (5.8%), 18p11 (5.8%) y Xq28 (4.9%). Además, exploramos la capacidad de MLPA sondas subteloméricas para la búsqueda de aneuploidías en CCR esporádico. Aneuploidía fue inferida en el 40% de los casos, las más frecuentes fueron la pérdida del cromosoma 4 (5.8%) y ganancia de los cromosomas 7 (19.6%), 20 (14.7%) y 13 (6.8%). Con estos resultados concluimos que la MLPA sondas subteloméricas es una alternativa de evaluación y de menor costo, que permite detectar las principales alteraciones cromosómicas tanto numéricas como estructurales en muestras de pacientes con CCR esporádico.
dc.description.tableofcontentsÍNDICE Lista de abreviaturas Índice de cuadros Índice de figuras Resumen Abstract Introducción V VI VI VIII IX XI 1. Antecedentes 1 1.1 Cáncer colorrectal 1 1.2 Epidemiología 2 1.3 Factores de riesgo para cáncer colorrectal 4 1.3.1 Factores de riesgo no modificables 5 1.3.2 Factores modificables 7 1.3.3 Factores posiblemente protectores 8 1.4 Tipos de cáncer colorrectal 9 1.5 Estadificación del cáncer colorrectal 9 1.5.1 Estadificación del CCR e impacto clínico 11 1.6 Clasificación de acuerdo a su origen 12 1.7 Vías moleculares para lla carcinogénesis 12 1.7.1 Mecanismos epigenéticos 16 1.7.2 Inestabilidad de microsatélites 17 1.7.3 Inestabilidad cromosómica 17 1.7.4 Vías de señalización en CCR 23 1.7.4.1 Vía WNT/j3-catenina 23 1.8 Métodos para determinar la Inestabilidad cromosómica en CCR 24 2 MLPA y aberraciones cromosómicas 32 3. Cáncer colorrectal, aberraciones cromosómicas y MLPA 33 4. Justificación 34 5. Planteamiento del problema 35 6. Hipótesis 36 7. Objetivos 36 7.1 Objetivos general 36 7.2 Objetivos particulares 36 8. Diseño Metodológico 37 8.1 Tipo de estudio 37 8.2 Universo de Estudio 37 8.3 Tamaño de muestra 37 8.4 Criterios de Selección 37 8.4.1 Criterios de Inclusión 37 8.4.2 Criterios de Eliminación 38 8.4.3 Criterios de Exclusión 38 8.5 Descripción de Procedimientos 38 8.5.1 Métodos 39 8.5.2 Ensayo MLPA 39 8.5.2.1 Muestras 39 8.5.2.2 Reacción MLPA 40 8.5.2.3 Análisis de datos 42 8.5.3 Detección de aneuploidías por FISH de tejidos 45 8.5.4 Análisis estadístico 45 9. Consideraciones éticas 46 1o. Definición operacional de variables 46 11. Resultados 49 11.1 Muestras de estudio 49 11.2 Variables clinicopatológicas investigadas 49 11.2.1 Género y edad 49 11.2.2 Antecedentes heredo-familiares de CCR 49 11.2.3 Diabetes tipo 2 52 11.2.4 Pólipos 52 11.2.5 Consumo de alcohol 52 11.2.6 Tabaquismo 53 11.3 Localización anatómiica 53 11.4 Clasificación tumoral 54 11.5 Estadificación 55 11.6 Diferenciación tumoral 55 11.7 Diseminación tumoral 55 12. Aberraciones cromosómicas por MLPA sondas subteloméricas 56 12.1 Comparación de hallazgos entre FISH y MLPA 59 13. Grupos de comparación 62 13.1 Aberraciones cromosómicas por edad de inicio 62 13.2 Aberraciones cromosómicas y antecedentes de pólipos 64 13.3 Aberraciones cromosómicas y diabetes tipo 2 65 13.4 Aberraciones cromosómicas por localización tumoral 67 13.5 Aberraciones cromosómicas por tipo tumoral 69 13.6 Aberraciones cromosómicas por estadio tumoral 70 13.7 Aberraciones cromosómicas por grado de diferenciación tumoral 72 13.8 Aberraciones cromosómicas y metástasis 73 14. Discusión 76 14.1 Variables clinicopatológicas investiigadas para CCR 76 14.1.1 Género y edad 76 14.1.2 Antecedentes heredo-familiares de CCR 76 14.1.3 Diabetes tipo 2 76 14.1.4 Pólipos 77 14.1.5 Consumo de alcohol 77 14.1.6 Tabaquismo 77 14.2 Localización anatómiica 78 14.3 Clasificación tumoral 78 14.4 Estadificación 79 14.5 Diferenciación tumoral 79 14.6 Diseminación tumoral 80 14.7 Aberraciones cromosómicas por MLPA sondas subteloméricas 81 14.8 Análisiis FISH y comparación de hallazgos con MLPA 86 14.9 Aberraciones cromosómicas por edad de inicio 86 14.1 o Aberraciones cromosómicas y antecedentes de pólipos 87 14.11 Aberraciones cromosómicas por localización tumoral 87 14.12 Aberraciones cromosómi cas por tipo tumoral 88 14.13 Aberraciones cromosómicas por estadio tumoral 89 14.14 Aberraciones cromosómicas por grado de diferenciación tumoral 89 15. Conclusiones 90 16. Limitaciones y perspectivas 91 17. Cronograma de actividades 91 18. Bibliografía 93 19. Anexos 103
dc.formatapplication/PDF
dc.language.isospa
dc.publisherBiblioteca Digital wdg.biblio
dc.publisherUniversidad de Guadalajara
dc.rights.urihttps://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp
dc.subjectCromosomicas
dc.subjectCancer
dc.subjectLigacion Multiple
dc.titleAberraciones cromosómicas en pacientes con cáncer colorrectal esporádico mediante su detección por amplificación de sondas dependiente de ligación múltiple
dc.title.alternativeAberraciones cromosómicas en pacientes con cáncer colorrectal esporádico mediante su detección por amplificación de sondas dependiente de ligación múltiple
dc.typeTesis de Doctorado
dc.rights.holderUniversidad de Guadalajara
dc.rights.holderRivera Vargas, Jehú
dc.coverageGUADALAJARA, JALISCO
dc.type.conacytdoctoralThesis
dc.degree.nameDOCTORADO EN GENETICA HUMANA
dc.degree.departmentCUCS
dc.degree.grantorUniversidad de Guadalajara
dc.degree.creatorDOCTOR EN GENETICA HUMANA
dc.contributor.directorBobadilla Morales, Lucina
Aparece en las colecciones:CUCS

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